XRD精修:精修软件和参考模型从哪里可以得到?
发布时间:2023-07-19来源:科学指南针 编辑:admin
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1. XRD衍射花样都包括什么内容?
图1 X射线衍射谱分解
2. XRD谱图精修需要进行哪些工作?
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软件
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数据
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初始模型(Le Bail等profile matching模式不需要)
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精修
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作图
A.软件。
软件有多种,算法基本一致,大部分使用的是最小二乘法。据某虫网站投票调查结果:排名前三的粉末精修软件依次为Gsas,Fullprof和Maud,还有Topas, expo等。前三均为开源版,在各自官网均可下载,这里附上Fullprof网址。
Fullprof Suite:
http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/fullprof/
图2 Fullprof网页部分截图。各个系统的软件下载以及使用手册和精修范例
网站还有一些特别有用的资源,比如:图中2所示的的使用手册和精修范例等等,可以多去翻翻点点,特别有用,比在小虫上求助的资料有用多了,或许有别的收获。Topas属于商业软件,有Topas Academic学术版可供下载作为学术交流使用。
B. 数据。
不同仪器测试所得的数据格式不尽相同,大部分为理学和布鲁克仪器,使用Jade都可打开,jade可以保存成Fullprof可识别的dat等多种格式;Gsas自带CMPR,可将数据转换成gsas格式。注意数据质量。详细步骤后面我会给出,附上视频。
C. 初始模型。
即参考的cif结构文件。先附几个可供下载cif的网站:
ICSD:https://icsd.products.fiz-karlsruhe.de/
CCDC:https://www.ccdc.cam.ac.uk/
COD:http://www.crystallography.net/cod/
MP:https://www.materialsproject.org/
PCOD:http://www.crystallography.net/pcod/search.html
以上网站均可下载,ICSD需要学校购买数据库。除了以上网站,可提供结构信息的还有安装版的PDF2009及以上;Findit等,较老版本在小虫上可以下载。对于大部分材料,使用这两个版本就行。
D. 精修。
这是一个费时的活儿,后面的推文会从(以Fullprof为例):
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认识精修(普适性)
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数据导入
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精修pcr控制文件准备
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精修顺序
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异常问题判断
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查看精修拟合结果
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输出拟合数据和CIF
这几个方面进行说明介绍。
E. 作图。
一般使用Origin作图即可。在第一次作图之后,将作图格式存为模板,接下来的作图直接一键套用模板即可,方便可调;也可保存为Ai格式。
图3 XRD精修谱图示例
本文来源 | XRD Refinement